Diseñado por Gilles Clément, el jardín forma parte integrante del museo: jardín boscoso, protegido del rumor de la calle de bordea el Sena por una alta empalizada de vidrio, se extiende en 18 000 m² y permite al quien lo recorre (visitante del museo, vecino del barrio o paseante) una impresión de exhuberancia. Lugar de la naturaleza y de la cultura, el jardía es una « invitación a viajar »: senderos, pequeñas colinas, caminos empedrados con cantos rodados, espejos de agua propicios para meditar y soñar... Se han reunido aquí 169 árboles, de una treintena de especies vegetales: robles y arces en el lado norte, magnolios y cerezos en el lado sur. Gracias a la construcción sobre pilotes, el jardín pasa por debajo del museo cuyo vientre se encuentra plantado con gramíneas de sotobosque. Aquí encontrará el visitante las taquillas de los billetes, en el exterior. El jardín encierra además un teatro de verdor, cuya programación propone espectáculos, conferencias y conciertos al aire libre.